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​- 이하, 재난지원금과 관련하여 2020.05.15일 내용 추가(문의가 지속되어 보강함) & 이에 맞춰 아래 내용 중 일부 단어와 문장 첨삭하였습니다. 

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① 재난지원금을 포함 연간 카드 소비액이 연 소득의 25%를 초과하면 신용/체크카드 소득공제를 받을 수 있습니다(행정안전부 2020.05.13일 발표 내용).

② 그런데, 신용카드 소득공제(일반적인 사업장에서 사용 시 소득공제)와 의료비 소득공제(의료기관에서 사용 시 추가 의료비 세액공제)는 구분하여야 합니다.
③ 관련법령 : 소득세법 제59조의4(특별세액공제)
    작성부서 : 국세청 서울지방국세청 중랑세무서 납세자보호담당관 

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귀하께서 문의하신 민원내용에 다음과 같이 알려드립니다.
의료비 세액공제 대상은 소득세법 제59조의4 제2항 및 같은 법 시행령 제118조의5 제1항에 따라 해당 근로자가 제1항 각호에 비용을 직접 부담하는 의료비로 규정하고 있습니다. 따라서, 정부 재난지원금으로 부담한 의료비는 근로자가 직접 부담하는 의료비에 해당하지 않아 의료비 세액공제 대상이 아닌것으로 판단됩니다.  
다만, 질의하신 내용은 추후 기획재정부 등 법률해석에 따라 공제여부에 대한 판단이 일부 달라질 수 있음을 양지하여 주시기 바랍니다.  
앞으로도 국세행정에 대한 지속적인 관심과 협조를 보내주시기 바랍니다. 감사합니다.

(요양기관에서 진료받은 의료비를 재난지원금으로 지출시 연말정산 소득공제 가능 여부 문의 - 내용보기)

출처 : 국민신문고 http://www.epeople.go.kr

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----------------------  아 래 - (권장사항) -------------------------